医院管理信息系统的原型开发是借助西南人民医院、蒙自妇幼保健院、佛山医院的专家学者组成的专家顾问来完成，主要功能的设计结合了我国现行医院的管理体制和经验方法，灵活的系统功能设置，其功能适合多数综合性、教学性及专科医院科室设置及职能,系统采用下拉式汉化菜单，先进友好的图形界面设计，操作简捷.人机界面直观、清楚、统一。
本系统包括门诊系统、药品管理系统、住院系统、统计分析系统，专家咨询系统和病案管理等子系统。
采用医院管理信息系统后病人可随时查询打印费用清单，所有花费一目了然。使用电子病历和无纸化处方使得门诊挂号划价交费的排队等待现象将不复存在，从而使病人在医院有效治疗的时间大大提高，对病人每次的诊疗检查等医疗信息进行计算机管理和存储为病人建立个人健康档案，能解决病人挂号时间长、交费时间长、取药时间长、看病时间短的门诊通病，还能为管理者提供决策所需动态数据。真正实现医疗质量提升，树立良好的窗口形象。
药品管理系统可对医生用药进行统计分析，药品回扣、大处方等现象可得到扼制，更好地保护了病人的利益 。科学合理的药品信息查询可方便药剂管理人员、临床医师及患者查询药品各种相关信息。更科学地对药品进行库存管理、流通管理、控制管理。能有效的防止药品、卫生材料的流失，减少库存积压和过期损耗，及时掌握设备的质量状况，一改以往医院每年为此造成重大经济损失的状况，对库房进行全面科学的管理，合理的使用每一分资金，全力提高医院的经济效益和管理水平。
住院管理系统科学合理的对各种病人进行统一管理，可实现全院各科室床位统计功能，使医院的床位利用率一目了然，方便的为新入院病人分配床位。对病人的住院资金实现计算机统一管理，杜绝了一切违法乱纪行为，使医院的资金始终处于科学的管理下。系统提供给病人方便快捷的查询功能，可查询病人的所有住院期间的各种费用。
医生护士工作站的设计思路是实现病人的疾病信息、治疗信息、护理信息可在受控的情况下供本科室、病案室、相关辅助科室等共享。使病人的各种医疗信息方便安全的共享，为病人的治疗恢复提供最大的支持。医师和护士可方便的了解本人所负责病人的具体情况，如：病人的基本信息、病历文书编辑信息、病人资金信息、病人既往病史及治疗信息、本次住院的各种治疗信息等等，同样使得注射单等可以自动打印，大大提高了工作效率。
财务管理可科学地接受各职能科室的日、月财务报表，采用科学合理进行医院的财务统一管理，合理的对各科室的奖金进行计算，核算各科室、个人工作量，使医院的财务管理合理化，透明化。
本系统使病人的权益得到了充分的尊重，同时也更加有效地提高了医院效率、管理水平和医疗服务质量。使医院为病人提供更好的服务，进而在激烈的市场竞争中立于不败之地 。
